Quelles données ?
QUELLES DONNEES et METHODES ?
Les cartes fournies représentent une agrégation des données par taxon (généralement l'espèce ou parfois au niveau taxonomique supérieur) pour l'ensemble des campagnes relatives à chacune des 3 façades. Les données proposées ne donnent qu'une valeur relative de la distribution des densités par espèce. Si elles donnent une bonne image de la distribution relative des taxa, elles ne fournissent donc pas une estimation quantitative et ne permettent donc en aucun cas de comparer les valeurs de densités des espèces entre-elles.
Campagnes & Données
Les campagnes fournissant les données de l'atlas sont réalisées par IFREMER dans le cadre de l'évaluation des ressources halieutiques et/ou du suivi des communautés et habitats benthiques. Chaque campagne sélectionnée pour constituer l'Atlas couvre une période et une zone géographique spécifiques et met en œuvre des engins de prélèvements différents. Les manuels des protocoles de campagnes décrivant les modalités techniques de réalisation de chaque série de campagnes sont disponibles sur le site du Système d'Information Halieutique de l'IFREMER.
| Façade | Campagne | Navire | Zone géographique | Période & série temporelle |
|---|---|---|---|---|
| Engin | Extension bathymétrique | Nombre total de stations | ||
| Atlantique | EVHOE | N/O Thalassa | golfe de Gascogne et mer celtique | Automne 2008-2011, 2013 |
| chalut à panneaux à large ouverture verticale (GOV 36/47) | 30-700m | 725 (≈ 145 stations/an) | ||
| LANGOLF | N/O Gwen Drez | golfe de Gascogne | Printemps 2011-2013 | |
| Chaluts jumeaux à langoustine (OTT 1521) | Grande Vasière, 40-135 m | 213 (≈ 71 stations/an) | ||
| NURSE | N/O Gwen Drez | baie de Vilaine, pertuis charentais, estuaires de la Loire et de la Gironde | Fin d'été 2000-2005, 2008-2010, 2012 | |
| Chalut à perche de 3m (CP3M) | 5-40 m | 995 (≈ 100 stations/an) |
Zone couverte et stations d'échantillonnage correspondant aux données issues des campagnes halieutiques NURSE, LANGOLF et EVHOE pour la façade Atlantique
| Façade | Campagne | Navire | Zone géographique | Série temporelle |
|---|---|---|---|---|
| Engin | Extension bathymétrique | Nombre total de stations | ||
|
Manche Mer du Nord |
CGFS | N/O Gwen Drez | Manche est, sud Mer du Nord | Données prochainement disponibles |
| chalut à panneaux à large ouverture verticale (GOV 36/47) | 5-100m | Données prochainement disponibles | ||
| IBTS | N/O Thalassa | Mer du Nord | Données prochainement disponibles | |
| chalut à panneaux à large ouverture verticale (GOV 36/47) | 20-100m | Données prochainement disponibles |
Zone couverte et stations d'échantillonnage correspondant aux données issues des campagnes halieutiques IBTS et CGFS pour la façade Manche/Mer du Nord.
| Façade | Campagne | Navire | Zone géographique | Série temporelle |
|---|---|---|---|---|
| Engin | Extension bathymétrique | Nombre total de stations | ||
| Méditerranée | MEDITS | N/O Europe | Golfe du Lion et est de la Corse | Données prochainement disponibles |
| Données prochainement disponibles | 20-900m | Données prochainement disponibles |
Zone couverte et stations d'échantillonnage correspondant aux données issues de la campagne halieutique MEDITS pour la façade méditerranéenne
Méthodologie pour l'obtention des cartes
Les données de densité d'abondance (taxon dénombrable) ou de densité de biomasse (taxon indénombrable) sont préalablement converties en valeurs relatives. Pour chaque espèce, une méthode de correction et d'agrégation des données permet de conserver au mieux les informations provenant d'une ou plusieurs campagnes décrivant le mieux sa distribution.
Les cartes sont ensuite générées par krigeage (krigeage simple, voisin mobile) en optimisant les paramètres (modèle variographique, distance et nombre de points) et la taille de la grille. La sélection des paramètres du voisinage mobile s'assure notamment que "le poids de la moyenne" corresponde à un minimum dans l'estimation des points krigés et que l'estimation de l'erreur moyenne (rapport de la moyenne krigée sur la moyenne des valeurs réelles) tende vers 1. Une pré-analyse a permis de fixer la résolution de la grille de krigeage pour l'ensemble des campagnes de la façade Atlantique à des cellules 2.5' de longitude par 4' de latitude (soit environ 5 par 7 km). Cette distance est un compromis prenant en considération la distance entre les stations de chacune des campagnes et les résultats du krigeage testés pour différentes tailles de grille.
Toutes les analyses ont été réalisées sous R3.0.2 (R Core Team, 2013) en utilisant les principales librairies suivantes: RGeostats 10.0.5 (krigeage), tripack 1.3-6 (triangulation & création des grilles), sp & PBSmapping 2.66.53 (génération des cartes).